2021年4月1日に「Z H2 SE」が新登場。型式は、2BL-ZRT00K
2020年モデルで新登場した「Z H2」の上位モデル。スーパーチャージャー(機械式過給機)を備えた排気量998ccの水冷並列4気筒エンジンやトレリスフレームなどは、「Z H2」と同様でこのベース車に走行状況や路面に応じて、最適な減衰力を提供する電子制御サスペンションを搭載し(ショーワのスカイフックテクノロジーを実装)、フロントブレーキにブレンボStylemaキャリパーを採用した。「Z H2 SE」は、過給機エンジン由来の圧倒的な動力性能を持ちながら、スムーズな乗り味やコントロール性をさらに追及した上位モデル。車両重量は、241kg。車体色は、1色(メタリックディアブロブラック×ゴールデンブレイズドグリーン)。
2021年12月17日に2022年モデルを発売。
カラー変更もなく継続販売。
2023年4月8日にマイナーチェンジ。型式は、8BL-ZRT00K
日本国内の平成32年(令和2年)排出ガス規制に適合で燃費が変更。車体色の配色などの変更があった。車体色は、1色(メタリックマットグラフェンスチールグレー×エボニー)。
2023年8月31日にマイナーチェンジ。型式は、8BL-ZRT00R
2024年モデルで標準仕様のZ H2が平成32年(令和2年)排出ガス規制をクリアしたのに合わせて、上位モデルのZ H2 SEの型式も、8BL-ZRT00Rに改められた。車体色は、1色(メタリックマットグラフェンスチールグレー×エボニー)。
2024年9月15日に2025年モデルを発売。
2024年モデルと同じカラーを継続販売。車体色は、1色(メタリックマットグラフェンスチールグレー×エボニー)。